独自ドメインのサイトを他ドメインのサブディレクトリに移行できる?

独自ドメインで運営中のサイトを、丸ごと他の独自ドメインのサブディレクトリへ移行できますか?
はい。可能です。

おくやまひろしさんによる写真ACからの写真

独自ドメインで運営中のサイト(https://example.com/)を、他の独自ドメインで運用中のサイト(https://example.jp/)のサブディレクトリ(https://example.jp/sub/)へ移行することは可能です。

なおその際、

  • ソースコードの変更
  • Google Analytics コードの変更
  • (データベースを使っていたら)データベースの変更
  • sitemapファイルの更新
  • 旧URLから新URLへのリダイレクト
  • サイト利用者への告知

といったことも必要となります。